青海由于东部地区的格鲁派、南部的噶举和宁玛派的强大势力和偏见，所以本教寺庙在清代一度受到打击和排斥。不过虽然如此，青海本教作为安多藏本教的一部分，在目前宗教信仰自由的气氛下，从 1982 年后，由于文嘉慈诚活佛和雍仲林支丹巴活佛的努力，还是有了相当恢复和发展。
同仁县曲库乎乡木合沙村，寺庙历史在七百年以上，活佛为文嘉慈诚，为本教在康多的三大学者之一，曾学法本教青海成就者温迦南喀坚藏，后来又在康区学习。寺庙人数为数百人，并建立有闭关房进行三年闭关。为青海目前最大的本教寺院。
二．杨兰贡巴 ：
贵南县森多乡王家地方，生活地区因为是牧区中心，所以十分艰苦。为雍仲林支丹巴活佛新建于 1990 年前后，因周边汉族称雍仲林支丹巴活佛为杨兰活佛，因此该寺庙一般称杨兰寺。
雍仲林支丹巴活佛 2002 年逝世，他是本教青海成就者文嘉南喀坚藏的外甥及亲传弟子，同时也是夏扎巴弟子容增堪布的弟子。先寺庙有活佛尼玛丹增。人数在 30 人左右。
青海绝大部分寺庙都归属莫柯萨寺的文嘉慈诚活佛或杨兰贡巴的雍仲林支丹巴活佛。
三．多西寺和下什塘寺
化陇县金源乡多西村，活佛扎义。人数共几十人。
四．王仓麻经堂
循化县文都乡。人数十几人。
贵德县河阴镇，活佛琼毛、瓦赛等，具有四个小型分院。人数近百人。
六．当车寺
贵德县河阴镇，人数一百人左右。据闻该寺活佛为家庭传递。
七．色加寺
贵德县河阴镇，人数一百人左右。
八．尕赛寺
共和县恰卜恰镇。建寺 200 年左右。活佛多居主持，人数几十人，其中并有在家瑜伽行者。
九．东格尔寺
共和县恰卜恰镇羊让村，僧人几十人。
